MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome

Total Repeats: 63684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002942	ACT	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840257
2	NC_002942	TTG	2	6	687	692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840257
3	NC_002942	AGC	2	6	757	762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840257
4	NC_002942	TTA	2	6	771	776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840257
5	NC_002942	TCGTT	2	10	785	794	0 %	60 %	20 %	20 %	52840257
6	NC_002942	T	8	8	815	822	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
7	NC_002942	GTAG	2	8	885	892	25 %	25 %	50 %	0 %	52840257
8	NC_002942	CTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840257
9	NC_002942	A	6	6	972	977	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
10	NC_002942	TAAA	2	8	1003	1010	75 %	25 %	0 %	0 %	52840257
11	NC_002942	A	6	6	1008	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
12	NC_002942	TTAT	3	12	1110	1121	25 %	75 %	0 %	0 %	52840257
13	NC_002942	G	7	7	1122	1128	0 %	0 %	100 %	0 %	52840257
14	NC_002942	CATG	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	52840257
15	NC_002942	AAT	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840257
16	NC_002942	GTATT	2	10	1200	1209	20 %	60 %	20 %	0 %	52840257
17	NC_002942	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840257
18	NC_002942	CAAA	2	8	1251	1258	75 %	0 %	0 %	25 %	52840257
19	NC_002942	TGA	2	6	1310	1315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840257
20	NC_002942	T	6	6	1323	1328	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
21	NC_002942	T	6	6	1356	1361	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
22	NC_002942	TTGG	2	8	1465	1472	0 %	50 %	50 %	0 %	52840257
23	NC_002942	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	52840257
24	NC_002942	ATTA	2	8	1523	1530	50 %	50 %	0 %	0 %	52840257
25	NC_002942	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	52840257
26	NC_002942	TCT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840257
27	NC_002942	AGTT	2	8	1723	1730	25 %	50 %	25 %	0 %	52840257
28	NC_002942	A	6	6	1747	1752	100 %	0 %	0 %	0 %	52840257
29	NC_002942	TAAAG	2	10	1769	1778	60 %	20 %	20 %	0 %	52840257
30	NC_002942	AATGGC	2	12	1832	1843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	52840257
31	NC_002942	GGT	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840257
32	NC_002942	GAT	2	6	1956	1961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840257
33	NC_002942	TCT	2	6	2004	2009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840257
34	NC_002942	A	6	6	2044	2049	100 %	0 %	0 %	0 %	52840258
35	NC_002942	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840258
36	NC_002942	T	6	6	2124	2129	0 %	100 %	0 %	0 %	52840258
37	NC_002942	AAAAC	2	10	2325	2334	80 %	0 %	0 %	20 %	52840258
38	NC_002942	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840258
39	NC_002942	TAG	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
40	NC_002942	ATG	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
41	NC_002942	TTG	2	6	2431	2436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
42	NC_002942	CAG	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840258
43	NC_002942	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
44	NC_002942	ATT	2	6	2524	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
45	NC_002942	TAA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840258
46	NC_002942	CAAA	2	8	2593	2600	75 %	0 %	0 %	25 %	52840258
47	NC_002942	A	6	6	2614	2619	100 %	0 %	0 %	0 %	52840258
48	NC_002942	ATT	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
49	NC_002942	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
50	NC_002942	TTG	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
51	NC_002942	CAAT	2	8	2709	2716	50 %	25 %	0 %	25 %	52840258
52	NC_002942	AATT	2	8	2732	2739	50 %	50 %	0 %	0 %	52840258
53	NC_002942	AG	3	6	2776	2781	50 %	0 %	50 %	0 %	52840258
54	NC_002942	ATTG	2	8	2800	2807	25 %	50 %	25 %	0 %	52840258
55	NC_002942	TTG	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840258
56	NC_002942	ACA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840258
57	NC_002942	AAT	3	9	2911	2919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840258
58	NC_002942	AAG	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840258
59	NC_002942	TGA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840258
60	NC_002942	ATT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840258
61	NC_002942	ATT	2	6	3303	3308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
62	NC_002942	ACG	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840259
63	NC_002942	CA	3	6	3392	3397	50 %	0 %	0 %	50 %	52840259
64	NC_002942	TAC	2	6	3425	3430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840259
65	NC_002942	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
66	NC_002942	GCTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	25 %	25 %	52840259
67	NC_002942	GTT	2	6	3533	3538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840259
68	NC_002942	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
69	NC_002942	TTA	2	6	3606	3611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840259
70	NC_002942	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	52840259
71	NC_002942	AT	3	6	3751	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
72	NC_002942	A	6	6	3791	3796	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
73	NC_002942	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52840259
74	NC_002942	TGATAG	2	12	3836	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840259
75	NC_002942	A	7	7	3848	3854	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
76	NC_002942	TA	3	6	3856	3861	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
77	NC_002942	CT	3	6	3927	3932	0 %	50 %	0 %	50 %	52840259
78	NC_002942	ACA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840259
79	NC_002942	A	6	6	3943	3948	100 %	0 %	0 %	0 %	52840259
80	NC_002942	TGA	2	6	4013	4018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840259
81	NC_002942	GCT	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840259
82	NC_002942	TTAA	2	8	4056	4063	50 %	50 %	0 %	0 %	52840259
83	NC_002942	AAC	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840259
84	NC_002942	AAT	2	6	4116	4121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840259
85	NC_002942	GTTT	2	8	4147	4154	0 %	75 %	25 %	0 %	52840259
86	NC_002942	TGA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
87	NC_002942	ATA	2	6	4513	4518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840260
88	NC_002942	GAT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
89	NC_002942	CAT	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840260
90	NC_002942	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
91	NC_002942	GAA	2	6	4743	4748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
92	NC_002942	GCT	2	6	4758	4763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840260
93	NC_002942	TGA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
94	NC_002942	AGA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
95	NC_002942	CA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	0 %	50 %	52840260
96	NC_002942	TGA	2	6	5105	5110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
97	NC_002942	A	6	6	5121	5126	100 %	0 %	0 %	0 %	52840260
98	NC_002942	GGC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52840260
99	NC_002942	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840260
100	NC_002942	TAAA	2	8	5173	5180	75 %	25 %	0 %	0 %	52840260
101	NC_002942	GTT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840260
102	NC_002942	ATG	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
103	NC_002942	AAC	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840260
104	NC_002942	TGG	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840260
105	NC_002942	AGC	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
106	NC_002942	AAT	2	6	5367	5372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840260
107	NC_002942	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
108	NC_002942	CAG	2	6	5527	5532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
109	NC_002942	GCA	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
110	NC_002942	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840260
111	NC_002942	GCA	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840260
112	NC_002942	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	52840260
113	NC_002942	GCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52840260
114	NC_002942	CTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840260
115	NC_002942	TCT	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840260
116	NC_002942	AAG	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
117	NC_002942	ATC	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840260
118	NC_002942	CTT	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840260
119	NC_002942	AG	3	6	6042	6047	50 %	0 %	50 %	0 %	52840260
120	NC_002942	AT	3	6	6062	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	52840260
121	NC_002942	ACC	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52840260
122	NC_002942	TAAAG	2	10	6092	6101	60 %	20 %	20 %	0 %	52840260
123	NC_002942	GAT	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840260
124	NC_002942	GAA	2	6	6228	6233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
125	NC_002942	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
126	NC_002942	TGC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52840260
127	NC_002942	AAG	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
128	NC_002942	ACA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840260
129	NC_002942	A	7	7	6677	6683	100 %	0 %	0 %	0 %	52840260
130	NC_002942	ACAA	2	8	6686	6693	75 %	0 %	0 %	25 %	52840260
131	NC_002942	AAC	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52840260
132	NC_002942	ACC	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52840260
133	NC_002942	AAG	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52840260
134	NC_002942	GTT	3	9	7297	7305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840261
135	NC_002942	ACC	4	12	7322	7333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52840261
136	NC_002942	GA	3	6	7479	7484	50 %	0 %	50 %	0 %	52840261
137	NC_002942	GGT	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840261
138	NC_002942	GAT	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840261
139	NC_002942	TAA	2	6	7630	7635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840261
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270	NC_002942	AT	3	6	16381	16386	50 %	50 %	0 %	0 %	52840268
271	NC_002942	ATA	2	6	16460	16465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840268
272	NC_002942	GTT	2	6	16471	16476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840268
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274	NC_002942	AGC	2	6	16568	16573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52840268
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276	NC_002942	AGT	2	6	16717	16722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52840268
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278	NC_002942	CAGG	2	8	16774	16781	25 %	0 %	50 %	25 %	52840268
279	NC_002942	TAAT	2	8	17036	17043	50 %	50 %	0 %	0 %	52840269
280	NC_002942	TGG	2	6	17105	17110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52840269
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282	NC_002942	TAA	2	6	17311	17316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52840269
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284	NC_002942	ATT	2	6	17355	17360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52840269
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304	NC_002942	T	6	6	18639	18644	0 %	100 %	0 %	0 %	52840270
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335	NC_002942	AAGG	2	8	19994	20001	50 %	0 %	50 %	0 %	52840271
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399	NC_002942	TTG	2	6	23481	23486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52840274
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402	NC_002942	CAAA	2	8	23642	23649	75 %	0 %	0 %	25 %	52840274
403	NC_002942	TA	3	6	23724	23729	50 %	50 %	0 %	0 %	52840274
404	NC_002942	ACT	2	6	23798	23803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52840274
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406	NC_002942	TCT	2	6	23871	23876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52840274
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